Я тут поспрошал иностранцев. Причина оказалась действительно очень простой: организаторы хотели отсечь от участия настоящие гоночные автомобили, которыми были машины поздних гонок Гордон-Беннетта и единственного на тот момент "большого приза". Самым реальным правилом было ограничение диаметра цилиндра, потому что у настоящих гоночных автомобилей он уже был более 150 мм. Тот факт, что участников набралось довольно много, говорит о том, что организаторы верно подобрали промежуток, в котором находились диаметры цилиндров тогдашних легковых автомобилей.
Минимальная масса в 1000 кг была выбрана потому, что у настоящих гоночных автомобилей была максимальная масса 1000 кг. Ну а поскольку гоночные машины уже отсекались требованием по диаметру цилиндра, требование по минимальной массе было, насколько я могу судить, скорее, декларативным: мол, у них должно быть меньше 1000 кг, а у нас - по-другому.